Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Hdac9Q99N13 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Hdac9Q99N13 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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