Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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