Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlgn1Q99K10 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms