Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Ddb2Q99J79 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Ddb2Q99J79 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Ddb2Q99J79 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Ddb2Q99J79 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Ddb2Q99J79 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Ddb2Q99J79 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Ddb2Q99J79 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Ddb2Q99J79 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Ddb2Q99J79 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ddb2Q99J79 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ddb2Q99J79 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ddb2Q99J79 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ddb2Q99J79 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ddb2Q99J79 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ddb2Q99J79 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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