Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Smim11aQ99J19 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Smim11aQ99J19 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Smim11aQ99J19 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Smim11aQ99J19 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Smim11aQ99J19 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Smim11aQ99J19 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Smim11aQ99J19 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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