Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Slc8b1Q925Q3 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Slc8b1Q925Q3 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms