Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim59Q922Y2 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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