Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD24

Zcchc18, Zinc finger CCHC domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc18Q8VD24 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zcchc18Q8VD24 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zcchc18Q8VD24 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zcchc18Q8VD24 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zcchc18Q8VD24 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zcchc18Q8VD24 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zcchc18Q8VD24 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zcchc18Q8VD24 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zcchc18Q8VD24 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zcchc18Q8VD24 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zcchc18Q8VD24 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zcchc18Q8VD24 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zcchc18Q8VD24 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zcchc18Q8VD24 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zcchc18Q8VD24 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zcchc18Q8VD24 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zcchc18Q8VD24 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zcchc18Q8VD24 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zcchc18Q8VD24 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zcchc18Q8VD24 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zcchc18Q8VD24 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zcchc18Q8VD24 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zcchc18Q8VD24 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zcchc18Q8VD24 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zcchc18Q8VD24 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zcchc18Q8VD24 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zcchc18Q8VD24 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms