Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdk8Q8R3L8 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdk8Q8R3L8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdk8Q8R3L8 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdk8Q8R3L8 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms