Protein–RNA interactions for Protein: Q8R349

Cdc16, Cell division cycle protein 16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc16Q8R349 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdc16Q8R349 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms