Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Trappc12Q8K2L8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Trappc12Q8K2L8 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Trappc12Q8K2L8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Trappc12Q8K2L8 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Trappc12Q8K2L8 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Trappc12Q8K2L8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Trappc12Q8K2L8 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Trappc12Q8K2L8 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
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Trappc12Q8K2L8 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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