Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms