Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI0

Nedd4l, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4lQ8CFI0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nedd4lQ8CFI0 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms