Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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Klf17Q8CFA7 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf17Q8CFA7 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf17Q8CFA7 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf17Q8CFA7 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf17Q8CFA7 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Klf17Q8CFA7 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf17Q8CFA7 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf17Q8CFA7 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf17Q8CFA7 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf17Q8CFA7 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Klf17Q8CFA7 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf17Q8CFA7 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Klf17Q8CFA7 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Klf17Q8CFA7 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Klf17Q8CFA7 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Klf17Q8CFA7 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Klf17Q8CFA7 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Klf17Q8CFA7 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Klf17Q8CFA7 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Klf17Q8CFA7 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Klf17Q8CFA7 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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