Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Usp27Q8CEG8 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Usp27Q8CEG8 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Usp27Q8CEG8 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Usp27Q8CEG8 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Usp27Q8CEG8 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Usp27Q8CEG8 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Usp27Q8CEG8 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Usp27Q8CEG8 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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