Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Pramef8Q8CE24 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Pramef8Q8CE24 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef8Q8CE24 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms