Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
4933409G03RikQ8C5U0 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4933409G03RikQ8C5U0 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms