Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Atg16l1Q8C0J2 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Atg16l1Q8C0J2 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Atg16l1Q8C0J2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Atg16l1Q8C0J2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Atg16l1Q8C0J2 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Atg16l1Q8C0J2 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Atg16l1Q8C0J2 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Atg16l1Q8C0J2 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Atg16l1Q8C0J2 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Atg16l1Q8C0J2 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Atg16l1Q8C0J2 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Atg16l1Q8C0J2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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