Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Ccl3-201ENSMUST00000001008 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm11875-201ENSMUST00000118187 799 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Grip1os1-201ENSMUST00000126965 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 1600010M07Rik-201ENSMUST00000185931 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm6197-201ENSMUST00000192273 454 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Olfr371-202ENSMUST00000218663 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 CT030238.2-201ENSMUST00000227382 1278 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Sncg-201ENSMUST00000023826 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Olfr1234-201ENSMUST00000099783 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Olfr1487-203ENSMUST00000209005 2061 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 4930510E17Rik-201ENSMUST00000034550 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Trpm3-205ENSMUST00000099566 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Trim35Q8C006 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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Trim35Q8C006 Mgst1-207ENSMUST00000140932 742 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm20594-201ENSMUST00000179797 449 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm8479-202ENSMUST00000204366 1070 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 AC154296.3-201ENSMUST00000214427 712 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 CT030238.4-201ENSMUST00000228579 801 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 H2-M10.5-201ENSMUST00000041531 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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