Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms