Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 184.4 ms