Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hirip3Q8BLH7 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms