Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms