Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan9Q8BJU2 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms