Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htatsf1Q8BGC0 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htatsf1Q8BGC0 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htatsf1Q8BGC0 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Htatsf1Q8BGC0 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htatsf1Q8BGC0 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Htatsf1Q8BGC0 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htatsf1Q8BGC0 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htatsf1Q8BGC0 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htatsf1Q8BGC0 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htatsf1Q8BGC0 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htatsf1Q8BGC0 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htatsf1Q8BGC0 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htatsf1Q8BGC0 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htatsf1Q8BGC0 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htatsf1Q8BGC0 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Htatsf1Q8BGC0 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htatsf1Q8BGC0 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Htatsf1Q8BGC0 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htatsf1Q8BGC0 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htatsf1Q8BGC0 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Htatsf1Q8BGC0 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms