Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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H2-M10.2Q85ZW9 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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H2-M10.2Q85ZW9 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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H2-M10.2Q85ZW9 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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H2-M10.2Q85ZW9 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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H2-M10.2Q85ZW9 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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H2-M10.2Q85ZW9 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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H2-M10.2Q85ZW9 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.2Q85ZW9 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.2Q85ZW9 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.2Q85ZW9 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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