Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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