Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
AknaQ80VW7 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms