Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Lrrc1Q80VQ1 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrc1Q80VQ1 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms