Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Ube2q1Q7TSS2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Ube2q1Q7TSS2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Ube2q1Q7TSS2 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2q1Q7TSS2 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms