Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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