Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm11365-201ENSMUST00000144277 774 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm5292-201ENSMUST00000073317 580 ntBASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
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NipblQ6KCD5 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Rpl7a-ps12-201ENSMUST00000120384 794 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
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