Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 579.7 ms