Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Usf2Q64705 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Usf2Q64705 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms