Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.1 ms