Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Irf4Q64287 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Irf4Q64287 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Irf4Q64287 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Irf4Q64287 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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