Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
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Ccdc18Q640L5 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Ccdc18Q640L5 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Ccdc18Q640L5 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Ccdc18Q640L5 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
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Ccdc18Q640L5 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
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