Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Gm28499-201ENSMUST00000191576 666 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Gm12774-201ENSMUST00000117881 416 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Olfr642-201ENSMUST00000052660 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Pvalb-202ENSMUST00000120592 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Gm44236-201ENSMUST00000204492 513 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 3110083C13Rik-202ENSMUST00000224786 907 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms