Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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