Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms