Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms