Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Tmem253Q3UNB8 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Tmem253Q3UNB8 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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