Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc34Q3UI66 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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