Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rnf180Q3U827 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Gm18621-201ENSMUST00000222677 679 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rnf180Q3U827 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rnf180Q3U827 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rnf180Q3U827 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Rnf180Q3U827 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Rnf180Q3U827 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
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