Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24925-201ENSMUST00000178157 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21045-201ENSMUST00000183058 1020 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7897-201ENSMUST00000193981 554 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19649-201ENSMUST00000201126 822 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 AC153974.1-202ENSMUST00000218700 678 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm40394-201ENSMUST00000221321 633 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15624-201ENSMUST00000145420 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43805-201ENSMUST00000198488 824 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44656-201ENSMUST00000208428 490 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 AC167202.1-201ENSMUST00000219027 331 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Tex9-214ENSMUST00000184831 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms