Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Q3U6N9 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Q3U6N9 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q3U6N9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q3U6N9 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q3U6N9 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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