Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U1D9 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U1D9 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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Q3U1D9 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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Q3U1D9 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U1D9 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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Q3U1D9 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U1D9 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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