Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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