Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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