Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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